葵涌货柜码头最早一宗确诊案例是一名六十三岁的男货柜车司机，上月二十三日确诊，之后陆续有码头员工确诊，主要集中在第一、二及五号码头，牵涉约十家公司。

对于码头成为感染高发区的原因，目前香港相关部门并未给出整体解释。部分防疫专家认为，此前一段时期内的免检疫船员、冻肉产品等均有可能是病毒输入源头；感染者集中出现，或与码头内的人员生活条件、习惯等有关。

按照相关职工联盟成员的说法：码头工人的休息室很紧迫，加上码头24小时运营，一天之间可能有数百名工人轮流使用同一休息室换衣服、睡觉及吃饭抽烟等，属于高危区，建议关闭码头。

因海运与香港本地居民生活所需的物资、生鲜产品等供应息息相关，香港的港口亦是华南地区重要的贸易中转站。因此，对于是否需要关闭相关码头以求彻底防疫，香港特区政府卫生防护中心传染病处主任张竹君称：把整个码头关闭是“很大件事”，虽然可以阻止疫情爆发，但很多货物经码头运抵香港，对香港运输很重要。

因华南多地的多个码头之间存在频繁的物资、货物往来关系，大量货车司机构成了疫情期间可相对方便进行跨境的群体之一。香港码头集中出现感染者会给这些跨境司机们带来什么影响，目前尚未确定。